島という土地柄、大昔より島外の犬種との
混血が進まず、島内の犬のみで近親な交配が行われてできた犬である。起源が不明のため
血統書は存在していない。また、
第二次世界大戦以降狩猟目的で日本国の内地に持ち込まれ、他犬種との混血が進んだため、現在では純血種は存在しないとされている。広義では、純粋な屋久島犬に、
狩猟のための改良目的で他犬種を掛け合わせたものを屋久島犬と呼ぶこともある。狩猟者の間では比較的純血種に近い屋久島犬が流通しているようであるが、一般人の間では、屋久島犬の曖昧な定義を利用したペットショップが、単なる猟犬の雑種を屋久島犬と称して販売し、流通していることが多い。
神経質でヒト慣れが悪い。主人以外のヒトにはなつきにくい。しかし近年狩猟用に他犬種との交配が進められたため、以前よりは扱いやすい犬になっているという。もともと島内で鹿を捕獲していたようで、鹿やイノシシ猟などの
大物猟に向いている。純粋な屋久島犬の体格は小-中型であるが、改良されたものはそれよりやや大きい。体色はほぼ単色、あるいは胸部に一部白を伴った赤茶色で、耳はピンと立ち、尾は
差し尾である。